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cobrawap collaborative brain wave analysis pipeline

Istituto Nazionale di Fisica Nucleare (INFN)

INFN


Responsabile unità operativa:

Pier Stanislao Paolucci

Etichetta Sistema di Calcolo

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Cobrawap, software per lo studio dell’attività cerebrale (sperimentale e simulata)

Cobrawap, software per lo studio dell’attività cerebrale (sperimentale e simulata)

Cobrawap (Collaborative Brain Wave Analysis Pipeline) è un software realizzato dall’Istituto Nazionale di Fisica Nucleare (INFN) in collaborazione con Juelich Research Center. Cobrawap offre una pipeline di analisi che fornisce un metodo di studio della dinamica cerebrale che può essere applicato sia a dataset sperimentali eterogenei (cioè acquisiti tramite varie tecniche di registrazione) che a simulazioni cerebrali. L’obiettivo di Cobrawap è quello di definire, e rendere disponibili alla comunità delle neuroscienze, metriche e soluzioni integrate di tipo “workflow” con cui valutare in modo quantitativo l’espressione dell’attività corticale, mettendola in relazione con gli stati di coscienza e con i processi cognitivi associati. Il software ha una struttura modulare ed è costruito per crescere in modo collaborativo, in un approccio di co-design per cui il codice viene sviluppato in risposta a uno specifico caso d’uso scientifico e, contemporaneamente, lo sviluppo del codice suggerisce e supporta l’estensione a ulteriori applicazioni. In ottica PaaS (Pipeline-as-a-Service) il personale INFN offre servizio di assistenza per l’utilizzo del software, per l’interpretazione dei risultati e per lo sviluppo e l’implementazione di funzionalità aggiuntive, soprattutto nei casi in cui sviluppi e “customizzazioni” possano tradursi in una collaborazione scientifica.


Tipi di accesso

Accesso virtuale ● Accesso remoto ● Accesso fisico

Beneficiari / Target users

Sono indicati i destinatari principali in relazione all’attuale TRL del servizio.

  • comunità scientifica (Università, Centri di ricerca, IRCCS)
  • industrie med-tech, pharma, biotech
  • studenti, dottorandi, early-stage researcher

Strumentazione


    Strumentazione
    Cluster di calcolo HPC INFN Roma

Cluster di calcolo HPC INFN Roma


Descrizione

» Tipologia di attività:

  • Sviluppo di nuove componenti di analisi e nuovi use-case scientifici

Immagine opzionale

» Possibilità di accesso:

  • Accesso on-site (su invito)

» Livello di supporto:

  • Su invito, nell’ambito di collaborazione

Informazioni aggiuntive

Beneficiari / Target users

Sono indicati i destinatari principali in relazione all’attuale TRL del servizio.

  • comunità scientifica (Università, Centri di ricerca, IRCCS)
  • industrie med-tech, pharma, biotech
  • studenti, dottorandi, early-stage researcher

Dettagli del servizio

Requisiti tecnici necessari per l’accesso

Standard tecnici per l’accesso al servizio

Risorse collegate al servizio

Modalità di accesso

Procedure di application e criteri di valutazione

Access Unit

Output del servizio

Contatti e supporto

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