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a glif data driven neuron models

Università degli Studi di Napoli Federico II

UNINA


Responsabile unità operativa:

Addolorata Marasco

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Sviluppo di modelli data-driven di neuroni e generazione di popolazioni eterogenee per reti neuronali spiking

Sviluppo di modelli data-driven di neuroni e generazione di popolazioni eterogenee per reti neuronali spiking

Il servizio offre competenze scientifiche e strumenti numerici per lo sviluppo di modelli point-neuron data-driven nell’ambito del framework integrate-and-fire (I&F). La facility sviluppa e utilizza modelli A-GLIF (Marasco et al 2023, 2024a), caratterizzati da basso costo computazionale e in grado di riprodurre la dinamica di firing di diverse tipologie neuronali. I modelli A-GLIF sono ottimizzati esclusivamente a partire da tracce somatiche sperimentali ottenute in risposta a step di corrente costanti (positivi e negativi) e sono in grado di replicare la dinamica di firing anche in presenza di input di corrente variabile, inclusi quelli di tipo sinaptico. Rispetto ai modelli I&F classici, gli A-GLIF consentono di riprodurre dinamiche complesse quali adaptation e firing block. Per ciascun neurone sperimentale, il modello A-GLIF è validato per essere statisticamente indistinguibile dalla controparte biologica. L’accuratezza del modello è inoltre quantificata tramite metriche specifiche riferite agli spike times e ai periodi silenti, utilizzando la suite di analisi STSimM (Marasco et al, 2025).

A partire dai modelli A-GLIF è possibile generare popolazioni neuronali eterogenee, mediante procedure numeriche che garantiscono che il firing di ogni modello di neurone generato rientri nel range di variabilità sperimentale (Marasco et al, 2024b). La produzione di ampi dataset di modelli consente così di riprodurre la naturale eterogeneità delle popolazioni neuronali in reti neuronali spiking, con applicazioni in ambito di ricerca di base, modellistica computazionale e sviluppo di modelli su larga scala.


Tipi di accesso

Accesso remoto

Beneficiari / Target users

Primariamente:

  • comunità scientifica (Università, Centri di ricerca, IRCCS)
  • studenti, dottorandi, early-stage researcher

Secondariamente:

  • industrie med-tech, pharma, biotech
  • clinici e professionisti della salute
  • policy maker e istituzioni

Servizio


    Servizio
    Sviluppo di modelli A-GLIF
    Generazione di popolazioni eterogenee
    Risorse HPC dotate di accelerazione GPU

Sviluppo di modelli A-GLIF


Descrizione

Sviluppo e ottimizzazione di modelli point-neuron A-GLIF a partire da dati elettrofisiologici di tracce somatiche ottenute in risposta a correnti costanti

  • Modelli di tipo I&F a basso costo computazionale

Sviluppo di modelli A-GLIF
  • Riproduzione di dinamiche complesse quali adaptation, firing block e spike latency

  • Capacità di replicare dinamiche di firing anche in presenza di input di corrente variabile, inclusi input sinaptici

  • Validazione statistica e definizione del grado di accuratezza nella riproduzione degli spike trains sperimentali

Informazioni aggiuntive

Beneficiari / Target users

Primariamente:

  • comunità scientifica (Università, Centri di ricerca, IRCCS)
  • studenti, dottorandi, early-stage researcher

Secondariamente:

  • industrie med-tech, pharma, biotech
  • clinici e professionisti della salute
  • policy maker e istituzioni

Dettagli del servizio

Requisiti tecnici necessari per l’accesso

Standard tecnici per l’accesso al servizio

Risorse collegate al servizio

Modalità di accesso

Procedure di application e criteri di valutazione

Access Unit

Output del servizio

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